Välkky 3 on suunniteltu niin, että jokainen opettaja voi sen avulla toteuttaa äidinkielen ja kirjallisuuden opetusta omalla tavallaan. Opetuksessa voi edetä kirjan järjestyksessä tai rakennella juuri omalle luokalle sopivia kokonaisuuksia. Välkyn rakenne on selkeä. Oppikirjan kuusi jaksoa ovat rakenteeltaan samanlaiset. Jaksot ovat painottuneet äidinkielen eri osa-alueisiin: Opiskelutaidot, Kieli ja kirjoittaminen, Kirjallisuus, Kieli, Viestintä ja tiedonhankinta sekä Kirjallisuus. Jokainen jakso sisältää kuitenkin monen eri osa-alueen asioita, ja vuorovaikutus, media ja yhdessä kirjoittaminen ovat mukana työtapoina kaikissa jaksoissa. Osa-alueet on merkitty oppikirjaan selkeästi, mikä helpottaa opetuksen suunnittelemista ja tekee oppimisen näkyväksi myös oppilaalle. Oppikirjan lopussa oleva Opin lisää -osio soveltuu eriyttämiseen ja oppilaiden omaehtoisen työskentelyn tueksi: sen avulla oppilaat voivat vaikkapa tehdä itse animaation tai perustaa lukupiirin.